Der Cranio-Sacral-Therapie liegt der craniosacrale Rhythmus zugrunde. Die Gehirn- und Rückenmarksflüssigkeit, die vom Cranium (Schädel) bis hin zum Sacrum (Kreuzbein) pulsiert, steht in enger Wechselbeziehung mit anderen Systemen, wie z. B. Hormonhaushalt oder Organfunktionalität. Cranio-Sacral-Therapeuten gehen ganzheitlich vor, sie beziehen also sowohl den Körper als auch Geist und Seele mit in die Behandlung ein.
Die Berührungen in der Cranio-Sacralen Therapie sind sehr sanft und wohltuend. Ähnlich wie in der Osteopathie, aus der die Cranio-Sacral-Therapie hervorgegangen ist, spielt die Aktivierung der Selbstheilungskräfte eine wichtige Rolle. Durch die Beseitigung von Funktionsstörungen im Bindegewebe wird eine Steigerung der Beweglichkeit und letztendlich eine Verbesserung des ganzen Systems erreicht.